CellCelector ソフトウェア
シングルセルとコロニーの自動検出と分離のためのユーザーフレンドリーで強力なソフトウェア
ALS CellCelector™ は、個々の単一細胞およびコロニーの自動分析およびピッキングのための非常に用途が広く柔軟なシステムです。これには、CellCelectorの多数の機能へのアクセスを提供すると同様に柔軟で強力なソフトウェアが必要です。
直感的で使いやすいグラフィカルユーザーインターフェイスは、実験のすべてのステップを通じてオペレーターをガイドします。さまざまなユーザーアクセスレベルにより、新しいオペレーターの集中的なトレーニングなしでソフトウェアに簡単にアクセスできると同時に、高度な機能、すべてのパラメーターへのオープンアクセス、キャリブレーション、およびパワーユーザー向けのカスタマイズ機能を提供します。これにより、日常の簡単な使用だけでなく、洗練された複雑な実験の実行も可能になります。
CellCelector™ 標準的な実験ワークフロー：
CellCelectorのユーザーインターフェースソフトウェアは、実験を5つの異なるワークフローステップに分割することにより、システムの標準的な実験ワークフローに合わせて調整されます。
- 必要なすべてのチャネル（明視野、位相差、蛍光）で画像を取得して保存するための、細胞培養プレートとディッシュのスキャン
- それらの画像の分析と目的の細胞またはコロニーの検出
- オプション）オペレーターによる分析結果のレビュー
- 検出されたシングルセルとコロニーのピッキング
- 実験結果の文書化とエクスポート
各実験ステップは専用のユーザーインターフェースに表示され、それぞれのステップに適切な量の機能とデータにアクセスできます。現在の実験ステップに関係のないすべてのオプションと機能はオペレーターから隠されているため、複雑さが軽減されます。
スキャニング
サンプルを含むプレートとディッシュは、電動顕微鏡ステージを採用した高解像度カメラによって自動的にスキャンされます。プレートは、最も一般的な市販のプレートフォーマットを含むプレートライブラリから選択され、カスタマイズされたフォーマットを作成することもできます。必要に応じて、追加のプレート、ディッシュ、またはスライドを簡単に追加できます。
アプリケーションの要件に応じて、スキャンは明視野、位相差、または最大6つの蛍光チャネルで実行できます。露出時間などのカメラ設定からフィルター設定や照明パラメーターなどのハードウェア設定までのすべてのイメージングパラメーターは、事前定義されたイメージング構成に保存されます。これにより、マウスをクリックするだけで異なるイメージング設定を切り替えることができます。スキャンするために、事前定義されたイメージング構成の任意の組み合わせを選択して、さまざまなチャネルおよび照明方法でマルチスペクトル画像を取得できます。
スキャンの保存されたすべての画像は、ソフトウェアによってスキャンされた領域の概要画像に結合されます。
分析と検出
このステップでは、保存されているすべての画像が分析され、オペレーターが定義したパラメーターに基づいて、標的細胞とコロニーが自動的に検出されます。
記録された各チャネルで検出された細胞またはコロニーごとに、ソフトウェアは、面積、直径、形状、球形度（真円度）などの形態学的測定のパネルを計算しています。これらのパラメーターにフィルターゲートを使用すると、分析結果をフィルタリングして、標的細胞とコロニーのみを特異的に検出できます。
ユーザーフレンドリーなプレビュー機能により、分析設定のリアルタイム検証と調整が可能です。
すべてのパラメータは、標準的な実験の簡単なルーチン分析を可能にする事前定義された分析設定として保存できます。
レビュー（オプション）
分析中、ソフトウェアは検出されたすべてのオブジェクトのリストを生成し、検出された各細胞またはコロニーについて選択されたすべての測定値のデータを示します。必要に応じて、これらのリストは、追加の数値フィルターを適用するか、画像ギャラリーで検出された細胞の画像を確認することにより、オペレーターが修正できるようになりました。画面上で直接興味深いオブジェクトを選択することにより、選択リストにアイテムを追加することもできます。
ピッキング
ALS CellCelector™ ピッキングされた細胞またはコロニーの生存率が高く、非常に穏やかなピッキングプロセスを促進します。したがって、CellCelector™ さらなる細胞培養、シングルセルクローニング、またはさまざまな分子分析法に最適です。
CellCelector™ ソフトウェアは、オペレーターが幅広いピッキングパラメーター（吸引およびディスペンス速度、容量、ピッキング高さなど）にアクセスできるようにすることで、これをサポートします。これらのパラメーターは、個々の単一細胞、懸濁液または半固形培地から付着コロニーへのクローンからの理想的なピッキング結果のために、個別に調整および最適化することができます。
これらのパラメーターを最適化することで、標準的な細胞培養ディッシュやウェルプレートからだけでなく、メンブレン、フィルター、顕微鏡スライドからもオブジェクトを選択できます。
ピッキング中、細胞はそれらのソース位置からそれらのデスティネーションプレートまでトレースされます。ソフトウェアはまた、ピッキング中にライブ画像を表示し、オペレーターに細胞ピッキング手順の優れた顕微鏡的可視性を提供し、ピッキングパラメーターの最適化を容易にします。
品質管理の目的で、ソフトウェアは各ピックの直前と直後に画像を自動的に保存し、後でピッキング結果を確認できるようにします（BFおよび/または任意の蛍光チャネルで）。オプションで、ソフトウェアはピッキングが成功したことを確認し、ピックリストの各ピックのステータスを自動的に記録できます。
画像をピッキングする前後の微視的な高品質が自動的に取得され、簡単にエクスポートできます。
成功したデポジットは、分配プレートをスキャンすることで視覚化できます。
ドキュメンテーション
完全な実験データは、ソフトウェアのドキュメントページにGLP準拠でリストされ、ドキュメント化されています。すべてのデータは、文書化とアーカイブのためにすばやく簡単にエクスポートできます。
検出/選択された各オブジェクトは、その独自のIDで識別でき、送信元から宛先までの完全なプロセスを通じて追跡できます。
選択したすべての細胞とクローンの画像を選択する前後のすべての画像と数値データ、および顕微鏡の高品質がCellCelector™ソフトウェアデータベースに保存されます。各セルの分取元と分配先のの位置は同じリストに記録されます。このようにして、ダウンストリームデータ（PCRや培養データなど）が利用可能になると、イメージングとピッキングのデータを後で簡単に再検討できます。
CellCelector™の利点と機能ソフトウェア
- 独自のプロトコルを作成し、すべてのパラメータにオープンアクセスできるため、研究開発アプリケーションの要件に最適です。
- グラフィカルな実験ワークフローと日常業務のための標準プロトコルの利用により使いやすい
- 高品質の画像処理、高度な画像処理と分析、高感度で正確なピッキングのための多数のパラメータによる高い柔軟性
- プロセス全体の完全でGLP準拠のドキュメント
- ソースプレートからデスティネーションプレートまでの各オブジェクトのデータ追跡
- 後続のドキュメントとアーカイブのためのすべての実験データのユーザー定義可能なエクスポート
- 独自のソフトウェア開発チームによる顧客のニーズと提案の適応によるソフトウェアの継続的な改善
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