シングル細胞の不均一性分析
CellCelector™ によるシングル細胞の分離とその後の不均一性分析用
ほぼすべてのセルラーシステムは異種であり、特殊な機能と生存率の向上に貢献しています。ゲノム、エピゲノム、トランスクリプトミクス、プロテオミクスの各レベルでの単一細胞の不均一性を深く理解することは、健康な状態と病気の状態の両方で生物の機能に与える影響を理解するために重要です。
さまざまな細胞や組織の種類に関する現在の知識のほとんどは、バルクアッセイから得られますが、数百から数百万の細胞を一緒に分析するため、細胞の不均一性の真のスペクトルを大幅に過小評価する可能性があります。
最新のテクノロジーでは、シングル細胞レベルでの分析が可能であるため、細胞の不均一性とその影響の理解に大きな一歩を踏み出しました。
シングル細胞の不均一性分析は、幹細胞がどのように運命を決定するかなどの発生経路を明らかにするのに役立ち、分化した組織の発生と維持に貢献します。これは、分化の欠如や誤った方向性によって引き起こされる悪性腫瘍を理解するためだけでなく、特に再生医療の分野にとっても重要です。
さらに、腫瘍の不均一性が癌の進展と臨床治療において重要な役割を果たしていることはよく知られており、したがって、治療抵抗性と進行の主要な要因です。したがって、腫瘍の不均一性を解明するシングル細胞レベルでの腫瘍のより良い理解は、癌の生存に大きな影響を与える可能性があります。腫瘍治療の個々の有効性に影響を与えるのは腫瘍自体の不均一性だけでなく、循環腫瘍細胞(CTC)内の突然変異でもあります。CTCは、原発腫瘍を離れて血流に入り、転移を促進している腫瘍細胞です。
全ゲノム増幅(WGA)などによってシングル細胞レベルで細胞の不均一性を分析するには、SNP検出またはシーケンスターゲット細胞を選択し、不均一なバックグラウンドから高純度で分離する必要があります。ALSCellCelector™は、100の自動識別と分離に最適なツールです。 %純粋な個々の単一セルは、他の方法に比べて多くの利点を提供します。
顕微鏡イメージングに基づいて、ターゲット細胞が検出され、単離のために選択されます。これにより、蛍光マーカーを利用したターゲット細胞の選択が可能になりますが、ターゲット細胞が発現する可能性のある明確な形態学的特徴を通じて、顕微鏡で見ることもできます。これにより、蛍光マーカーとは無関係にターゲット細胞をラベルフリーで検出できます。さらに、分離中のライブ画像、および分離された各単一細胞の画像をピッキングする前後の自動記録により、ピッキングプロセスの包括的なドキュメントが作成され、非標的細胞の汚染なしにターゲット細胞のみがピッキングされていることが保証されます。高速分離プロセスは非常に穏やかで、高い細胞完全性(クローニングアプリケーションで最大100 %の増殖率)と最大100 %の卓越した転写効率をもたらします。
関連する出版物
- Segerman, A. et al. Clonal Variation in Drug and Radiation Response among Glioma-Initiating Cells Is Linked to Proneural-Mesenchymal Transition Cell Reports 17: 2994-3009 (2016)
- Neumann, M.H. et al. Isolation and characterization of circulation tumor cells using a novel workflow combining CellSearch® and CellCelector
™ Biotechnol Prog. 33(1): 125-132 (2016)
- Yao, X. et al. Tumor cells are dislodged into the pulmonary vein during lobectomy J. Thorac Cardiovasc. Surg. 148(6): 3224-31 (2014)
- Heidary, M. et al. The dynamic range of circulating tumor DNA in metastatic breast cancer Breast Cancer Res. 16(4): 421 (2014)
- Lohr, G.J. et al. Whole-exome sequencing of circulating tumor cells provides a window into metastatic prostate cancer Nature Biotechnology 32: 479-484 (2014)
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